R的极客理想系列文章，涵盖了R的思想，使用，工具，创新等的一系列要点，以我个人的学习和体验去诠释R的强大。
R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。现在已不仅仅是统计领域，教育，银行，电商，互联网….都在使用R语言。
要成为有理想的极客，我们不能停留在语法上，要掌握牢固的数学，概率，统计知识，同时还要有创新精神，把R语言发挥到各个领域。让我们一起动起来吧，开始R的极客理想。
关于作者：
- 张丹，分析师/程序员/Quant: R,Java,Nodejs
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http://blog.fens.me/r-markdown-rmarkdown/
前言
Markdown格式文档编写，已经从小众成为了一种主流的文档编写方式。R语言社区在可重复性文档编写领域中，有着重要的贡献。knitr和rmarkdown等包的支持，到后来在RStudio中直接集成的rmarkdown的功能，让R的广大用户有了非常舒服的markdown文档使用体验。
2015时，我就已经开始用markdown来写书稿，当时写了2篇关于在nodejs领域中使用markdown的文章，Marked高效的Markdown解析器，用WebStorm编辑Markdown。
时光证明了，小而美的好东西，真的会放大光芒。改变用户使用习惯，从小而美开始。
目录
- 创建一个rmarkdown文档
- 嵌入markdown文本
- 嵌入R代码
- 嵌入DT动态表格
- 嵌入echarts动态图
- 嵌入数学公式
1. 创建一个rmarkdown文档
写文档的常规操作是用word，程序员写文档的常规操作是用IDE的编程工具，用markdown格式来写文档，最后可生成word、pdf、html等文档。
我们今天讲讲怎么用R语言来写文档吧，那么R语言对markdown的支持包是rmarkdown包，现在新版的RStudio开发工具，已经集成了rmarkdown包，我们直接在RStudio中操作就行了。
首先我们先打开RStudio开发工具，选择新建一个R Markdown文件。
选择Document文档格式，设置Title, Author, Date等基本信息，然后可以选择文档输出格式HTML, PDF, Word的三种选择，不同的格式输出需求本机已经安装对应的其他软件。
打开新创建的文档，默认会是一个模板，以rmarkdown的格式进行展示，上面所输入的参数，在文档都的开头部分都有展示。然后保存一下文件。
我们可以点击Knit的下拉菜单，选择输出为HTML。
然后，运行Knit就会新打开一个窗口，看到HTML的网页输出。
如果想输出为word格式，重新选择 Knit到word就行了，运行后会弹出word的新生成的文件。
一通操作下来，功能切换很是顺畅，体验非常舒服。那么接下来就在rmarkdown中，加入各种元素，让整个文档丰富起来。
2. 嵌入markdown文本
在rmarkdown中嵌入markdown文本，是最基本的操作，在默认生成的文档中，就是一个带有markdown格式的文本。markdown格式的文本，包括10种主要的格式，分别是标题，字体，引用，分隔，图片，链接，列表，表格，代码。
2.1 标题
标题支持六级标题，用#做为开头，#的数量表示是几级标题。
# 这是一级标题
## 这是二级标题
### 这是三级标题
#### 这是四级标题
##### 这是五级标题
###### 这是六级标题
图中，左边中编辑界面，右边是HTML的输出界面。
2.2 字体
字体格式设置有2种方法，一种是就markdown默认支持的4种格式，加粗，斜体，斜体加粗，删除线。另一种方法就是使用html的标签<font>来进行设置。
**这是加粗的文字**
*这是倾斜的文字*`
***这是斜体加粗的文字***
~~这是加删除线的文字~~
<font face="宋体">宋体</font>
<font face="宋体" color="red">红色宋体</font>
<font face="宋体" color="red" size="5">5号红色宋体</font>
2.3 引用
使用>用于表示引用外部的一段话，在引用中可以用\来进行换行。
> 我要引用一段文字\
\
R语言作为统计学一门语言，一直在小众领域闪耀着光芒。直到大数据的爆发，R语言变成了一门炙手可热的数据分析的利器。随着越来越多的工程背景的人的加入，R语言的社区在迅速扩大成长。现在已不仅仅是统计领域，教育，银行，电商，互联网….都在使用R语言。
2.4 分隔
在markdown中，可以通过3个连续的-或*，来设置分隔符。
--开始
---
**开始
********************
结束
2.5 图片
插入图片时，需要使用语法。
2.6 链接
设置超级链接，有2种写法，一种就是[显示文字](链接)，另一种是<链接>。
[粉丝日志博客](fens.me)
<http://www.fens.me>
2.7 列表
列表支持3种语法，一种是无序列表，二是有序列表，三是嵌套列表。
- 无序列表，用 – + * 任何一种都可以，跟内容之间都要有一个空格
- 有序列表，用数字加点，跟内容之间都要有一个空格
- 嵌套列表，上一级和下一级之间有三个空格，跟内容之间都要有一个空格
无序列表
+ 列表内容
+ 列表内容
+ 列表内容
有序列表
1. 列表内容
2. 列表内容
3. 列表内容
无序列表嵌套
+ 1 列表内容
+ 1.1 列表内容
+ 1.2 列表内容
+ 2 列表内容
+ 3 列表内容
2.8 表格
在嵌入表格时，需求包括表头行，分隔符行，表体行。表头行用|分隔，表体行也用|分隔，分隔符行需要用–|组合进行分隔。当希望单元格整列对齐时，可以分隔符行加:来控制对齐，文字默认居左，两边加表示文字居中，右边加：表示文字居右。
表头|表头|表头
---|:--:|---:
内容|内容|内容
内容|内容|内容
表头|表头|表头
--|--|--
内容|内容|内容
内容|内容|内容
2.9 代码
代码的嵌入可以分为行内代码嵌入代码和代码块。
- 行内代码，需要使用”包住代码，代码不可换行。
- 代码块，需要用“` “`来包住代码，代码可换行。
文字中内嵌了`a="abc"`代码
```
a="abc"
a1=2
a2=3
a3=a1+a2
```
Markdown的基本语法，就是这9部分很简单，写一次练习一下，就记住了。
3. 嵌入R代码
上面我们演示了在markdown中嵌入代码，那么对于R语言来说，如果我们希望嵌入R代码，需要代码块针对R代码做一些支持的时候，要怎么写呢。
```{r}
a<-Sys.Date()
a
head(iris)
plot(iris)
```
接下来，我们还可以在{r echo=FALSE}加入echo=FALSE，这样就不输出R的代码本身了。
```{r echo=FALSE}
library(xts)
xdf<-xts(rnorm(100),order.by = as.Date('2022-01-01')+1:100)
plot(xdf)
```
4. 嵌入DT动态表格
在R的代码中，我们可以调用R的各种包进行输出，可以使用DT包来做动态表格，只要把数据放到datatable()函数中，就可以在markdown中生成对应的动态表格，支持翻页、关键字搜索，排序等多种功能。
```{r}
library(DT)
datatable(iris)
```
5. 嵌入echarts动态图
在文档输出时，经常需要用图进行展示，我们也可以直接使用echart4r包来调用echarts进行多种图的可视化展示。
```{r}
library(echarts4r)
library(magrittr)
iris %>%
e_charts(x = Sepal.Length) %>%
e_scatter(serie = Sepal.Width )
```
6. 嵌入数学公式
文档中，也避免不了经常会写一些数据公式 ，rmarkdown中也集成是嵌入数据公式的功能。我们可以直接使用$$公式$$的语法，来生成复杂的数学公式。在文档中加入数学公式，是使用mathjax格式来进行数学公式的编辑。
$$
\hat\beta_1=\frac{\sum\left(X_i-\overline{X}\right)Y_i}{\sum\left(X_i-\overline{X}\right)^2}=\frac{\sum X_iY_i-\overline{X}\sum Y_i}{\sum X_i^2+\sum \overline{X}^2 - 2\overline{X}\sum X_i}\\
=\frac{\sum X_iY_i-\overline{X}*N\overline{Y}}{\sum X_i^2+N\overline{X}^2 - 2\overline{X}*N\overline{X}}
=\frac{\sum^{N}_{i=1} X_iY_i-N\overline{XY}}{\sum^{N}_{i=1}Xi^2-N\overline{X}^2}
$$
本文我介绍了rmarkdown的功能，有非常丰富的支持，多样的表达形式，语法简单，而且是可重复性生成的，比起 word 写文档，有更多的编程的特点。写书，写论文，写标书，写文档，都是不错的选择。
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